本校の歴史は古く、明治37(1904)年4月に旧岐阜市立岐阜商業学校が、昭和10(1935)年に旧岐阜市立女子商業学校がそれぞれ開校し、その後公立高等学校再配置により両校が統合され、昭和23(1948)年に岐阜市立岐阜商業高等学校として発足しました。さらに翌年には公立高等学校学区制実施により、岐阜市立岐阜商業高等学校は消滅し、生徒は長良高等学校、岐阜高等学校、加納高等学校の商業課程に配置されますが、昭和26(1951)年3月に岐阜県立岐阜商業高等学校設置の旨が岐阜県教育委員会より認可され、4月に岐阜市野一色において開校しました。